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第一步：确定分离物。首先在进行离心分离实验前，你要分清你需要离心分离的物质是保留上清液还是沉淀物，这样才会更明确的进行实验。

第二步：合理选取转子及离心管。对于离心转子和相应离心管的选择，最好在查阅相关文献后先用相近的转子参数进行设置或选取。而在普通的悬浮液分离时最好用尖底的离心管，这样可以更好的使沉淀物质更好的贴壁，沉淀物堆积也较好。

第叁步：分离环境准备。这一步对于需要低温离心的东西非常重要，首先要注意先设定离心温度（针对冷冻离心机而言），使离心腔预冷，达到实验要求的工作温度，为分离实验做准备。

第四步：离心参数设置。这一步才要选择合适的转速或是离心力。一定要选择对的条件，过低的条件达不到效果，过高的条件会使物质有所损失。所以要进行好的参考，并且结合相关经验。注意离心物质的配平。

第五步：安全事项。盖好离心机盖子，这一步一定要保证好好盖严实，因为如果盖的不好是容易发生危险的。

第六步：注意细节。要注意最后的上清的保留或是沉淀的保存，切记取上清或是弃上清一定要快，这样才能不会随时间造成部分的混悬，造成好的实验结果。